Dự thảo thông tư quy định chi tiết hồ sơ, trình tự và thủ tục xác nhận ưu đãi cho các dự án sản xuất sản phẩm công nghiệp hỗ trợ, được áp dụng đối với các tổ chức, cá nhân trong nước và nước ngoài tham gia các hoạt động sản xuất sản phẩm công nghiệp hỗ trợ trên lãnh thổ Việt Nam. Các sản phẩm sản xuất thuộc danh mục sản phẩm công nghiệp hỗ trợ ưu tiên phát triển được ban hành kèm theo Nghị định số 111/NĐ-CP được hưởng ưu đãi, hỗ trợ theo quy định của Nghị định, trừ ưu đãi thuế thu nhập DN.
Dự thảo thông tư cũng quy định hồ sơ đề nghị xác nhận ưu đãi gồm văn bản đề nghị xác nhận ưu đãi, bản sao GCN đăng ký DN hoặc GCN đăng ký kinh doanh; thuyết minh dự án; bản sao báo cáo kiểm toán độc lập năm gần nhất trước thời điểm nộp hồ sơ xin xác nhận ưu đãi; quyết định phê duyệt báo cáo đánh giá tác động môi trường (đối với dự án đầu tư mới) hoặc xác nhận hoàn thành công trình, biện pháp bảo vệ môi trường (đối với dự án đang hoạt động); bản sao GCN hợp chuẩn theo tiêu chuẩn kỹ thuật của Liên minh Châu Âu (EU) hoặc tương đương (nếu có).
Tổ chức, cá nhân sau khi được hưởng các ưu đãi đầu tư, hàng năm (trước ngày 31-1 năm sau) có trách nhiệm báo cáo Bộ Công Thương tình hình sản xuất kinh doanh các sản phẩm được hưởng ưu đãi.
Dự thảo thông tư cũng quy định, kể từ khi được xác nhận ưu đãi, các tổ chức, cá nhân không tiến hành triển khai hoạt động trong thời gian 12 tháng liên tục sẽ bị thu hồi xác nhận ưu đãi.