DN chế xuất có hàng hóa nhập khẩu để xuất khẩu thì không được hoàn thuế GTGT, số thuế GTGT đã nộp ở khâu nhập khẩu được khấu trừ. Ảnh Thu Hằng.

Theo quy định tại Thông tư số 219/2013/TT-BTC hướng dẫn về đối tượng không chịu thuế, hàng hoá, dịch vụ được mua bán giữa nước ngoài với các khu phi thuế quan và giữa các khu phi thuế quan với nhau.

Bên cạnh đó, doanh nghiệp chế xuất được cấp Giấy phép kinh doanh hoạt động mua bán hàng hóa và các hoạt động liên quan trực tiếp đến mua bán hàng hóa tại Việt Nam phải mở sổ kế toán hạch toán riêng doanh thu, chi phí liên quan đến hoạt động mua bán hàng hóa tại Việt Nam và bố trí khu vực lưu giữ hàng hóa ngăn cách với khu vực lưu giữ hàng hóa phục vụ hoạt động sản xuất của doanh nghiệp chế xuất hoặc thành lập chi nhánh riêng nằm ngoài doanh nghiệp chế xuất, khu chế xuất để thực hiện hoạt động này.

Mặt khác, tại Nghị định số 100/NĐ-CP ngày 1-7-2016 đã hướng dẫn phân bổ số thuế GTGT đầu vào trường hợp không hạch toán riêng số thuế GTGT đầu vào sử dụng cho sản xuất kinh doanh hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu thì số thuế GTGT đầu vào xác định theo tỷ lệ giữa doanh thu của hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu trên tổng doanh thu hàng hóa, dịch vụ của các kỳ khai thuế GTGT tính từ kỳ khai thuế tiếp theo kỳ hoàn thuế liền trước đến kỳ đề nghị hoàn thuế hiện tại.

Theo Tổng cục Thuế, căn cứ quy định trên, trường hợp DNCX thực hiện hoạt động sản xuất để xuất khẩu thì không phải nộp, khai thuế GTGT, không được hoàn thuế GTGT.

Với trường hợp DNCX mua hàng hóa, dịch vụ của DNCX khác phục vụ cho hoạt động sản xuất để xuất khẩu thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT.

Trường hợp DNCX được cấp Giấy phép kinh doanh hoạt động mua bán hàng hóa và các hoạt động liên quan trực tiếp đến mua bán hàng hóa tại Việt Nam thì DNCX phải thực hiện đăng ký với cơ quan thuế nội địa để kê khai, nộp thuế GTGT, sử dụng hóa đơn như doanh nghiệp nội địa. Khi đó theo quy định Luật số 106/2016/QH13, trường hợp DNCX có hàng hóa nhập khẩu để xuất khẩu (bán cho tổ chức ở nước ngoài hoặc DNCX khác) thì không được hoàn thuế GTGT, số thuế GTGT đã nộp ở khâu nhập khẩu được khấu trừ.