Thế nhưng,ộrốtráothựchiệnmụctiêuhạtỷlệkiểmtrachuyênngànhxuốngcòbảng xếp hạng hạng 2 số lượng lô hàng phải KTCN cho đến hiện nay vẫn ở mức khoảng 33%. Nghịch lí ở chỗ số lượng các lô hàng phải KTCN rất lớn nhưng số lượng phát hiện sai phạm chưa được 0,14%.
Đây là một trong những vấn đề tồn tại của công tác KTCN hàng hóa xuất nhập khẩu (XNK) được Phó Thủ tướng Vương Đình Huệ nêu ra tại phiên họp thứ ba của Ủy ban Chỉ đạo quốc gia về Cơ chế một cửa quốc gia, Cơ chế một cửa ASEAN và tạo thuận lợi thương mại diễn ra mới đây.